Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CtsmQ9JL96 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.2 ms