Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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