Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ybx3Q9JKB3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms