Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tpm1-213ENSMUST00000113697 1742 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Pgpep1Q9ESW8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms