Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
OtofQ9ESF1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
OtofQ9ESF1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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