Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smg9Q9DB90 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms