Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fundc1Q9DB70 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms