Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snx5Q9D8U8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms