Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Snx20Q9D2Y5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Snx20Q9D2Y5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Snx20Q9D2Y5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx20Q9D2Y5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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