Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Q9D1F3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms