Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms