Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Zbed3Q9D0L1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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