Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nip7Q9CXK8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nip7Q9CXK8 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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