Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Sgo1Q9CXH7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sgo1Q9CXH7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sgo1Q9CXH7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms