Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prkrip1Q9CWV6 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms