Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
NubplQ9CWD8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
NubplQ9CWD8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms