Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Lhfpl3Q9CTN8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms