Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ykt6Q9CQW1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms