Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms