Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms