Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms