Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rab5aQ9CQD1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms