Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Efcab2Q9CQ46 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efcab2Q9CQ46 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efcab2Q9CQ46 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efcab2Q9CQ46 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efcab2Q9CQ46 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efcab2Q9CQ46 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Efcab2Q9CQ46 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Efcab2Q9CQ46 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Efcab2Q9CQ46 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Efcab2Q9CQ46 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efcab2Q9CQ46 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms