Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chmp3Q9CQ10 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms