Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atg3Q9CPX6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms