Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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