Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cep41Q99NF3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cep41Q99NF3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms