Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NsmfQ99NF2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms