Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms