Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms