Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pacsin3Q99JB8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms