Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ddb2Q99J79 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ddb2Q99J79 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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