Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Csmd1Q923L3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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