Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp3Q91W36 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms