Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg8Q8VE18 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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