Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Fam20bQ8VCS3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fam20bQ8VCS3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms