Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ApobrQ8VBT6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ApobrQ8VBT6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms