Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Vmn1r200Q8R281 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Vmn1r200Q8R281 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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