Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hecw1Q8K4P8 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms