Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
OptnQ8K3K8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
OptnQ8K3K8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms