Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vrk3Q8K3G5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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