Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Trim68Q8K243 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim68Q8K243 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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