Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cldn34c1Q8K193 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms