Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc178Q8CDV0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc178Q8CDV0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc178Q8CDV0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc178Q8CDV0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc178Q8CDV0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc178Q8CDV0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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