Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc9Q8CDN9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Lrrc9Q8CDN9 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Lrrc9Q8CDN9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Lrrc9Q8CDN9 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lrrc9Q8CDN9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lrrc9Q8CDN9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lrrc9Q8CDN9 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrrc9Q8CDN9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms