Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nhlrc3Q8CCH2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nhlrc3Q8CCH2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nhlrc3Q8CCH2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Nhlrc3Q8CCH2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Nhlrc3Q8CCH2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Nhlrc3Q8CCH2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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