Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slfn5Q8CBA2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slfn5Q8CBA2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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