Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cnot2Q8C5L3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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