Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q8C5C9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Q8C5C9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms