Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms